Tributação de clínicas: evite erros e pague menos impostos

Richard Riviere
14 de novembro de 2025
Seta apontando para baixo.
tributação de clínicas

Descubra como funciona a tributação de clínicas e consultórios e veja como um sistema médico pode simplificar sua gestão fiscal e reduzir impostos.

A tributação é uma das maiores preocupações na rotina de clínicas e consultórios médicos. Nesse sentido, compreender o sistema tributário e manter uma boa organização financeira é o que garante a sustentabilidade e o crescimento do seu negócio em saúde.

Afinal, assim como uma boa recepção impacta na experiência do paciente, uma gestão tributária eficiente impacta na saúde financeira da sua clínica. 

Segundo o Doc Concierge, em matéria para o Portal Terra, uma consultoria especializada no atendimento a médicos, escolher o regime errado pode elevar a carga tributária em até 20% ao ano. 

É nesse ponto que a tecnologia se torna uma aliada estratégica, integrando faturamento, emissão de notas fiscais e relatórios financeiros em um só ambiente. Tudo isso reduz erros e facilita a comunicação com o contador.

Neste artigo, você vai entender como funciona a tributação de clínicas e consultórios, quais são os principais regimes fiscais disponíveis para profissionais da saúde e como o uso de um sistema simplifica sua rotina tributária.

Vamos começar!

Entendendo a tributação de clínicas e consultórios

A tributação médica está diretamente ligada ao formato jurídico e ao regime de enquadramento da sua clínica. 

Desse modo, dependendo da forma como a empresa foi constituída, as regras e alíquotas aplicadas podem variar de forma significativa.

Para clínicas e consultórios, é preciso abrir uma Pessoa Jurídica (PJ) para se manter dentro da lei, reduzir a carga tributária e ter mais flexibilidade na gestão financeira. Porém, isso exige um bom planejamento contábil e a escolha do regime correto.

Os principais tributos pagos por clínicas e consultórios incluem:

  • IRPJ (Imposto de Renda Pessoa Jurídica)
  • CSLL (Contribuição Social sobre o Lucro Líquido)
  • PIS e COFINS (Contribuições sobre o faturamento)
  • ISS (Imposto sobre Serviços), cobrado pelo município
  • INSS Patronal

Gerenciar esses tributos de forma manual aumenta o risco de erros, pagamentos indevidos e atrasos. Por isso, contar com um sistema médico integrado automatiza processos e evita retrabalho.

Regimes tributários disponíveis para clínicas médicas

A escolha do regime tributário é uma das decisões mais importantes na abertura ou reestruturação de uma clínica. Veja os três principais regimes utilizados por médicos:

a) Simples Nacional

Em primeiro lugar, ideal para clínicas com faturamento anual de até R$ 4,8 milhões, o Simples Nacional unifica diversos impostos em uma guia única (DAS).

A tributação ocorre de forma simplificada e a alíquota varia conforme o faturamento, variando entre 6% e 15,5%.

Vantagens:

  • Menor burocracia e unificação de tributos;
  • Custos contábeis reduzidos;
  • Cálculo automático de impostos.

Porém, dependendo da folha de pagamento e da receita, a clínica pode cair em faixas mais altas de tributação.

b) Lucro Presumido

Indicado para clínicas que faturam até R$ 78 milhões por ano e têm uma margem de lucro previsível. Nesse regime, o governo “presume” um percentual de lucro sobre o faturamento (geralmente 32% para serviços médicos) e aplica os impostos sobre essa base.

Vantagens:

  • Pode ser mais vantajoso que o Simples em alguns casos;
  • Permite o uso de créditos e deduções específicas.

Contudo, o controle financeiro precisa ser rigoroso, pois os impostos são calculados trimestralmente.

c) Lucro Real

Obrigatório para clínicas com faturamento acima de R$ 78 milhões, mas pode ser adotado por qualquer empresa. Nesse regime, os impostos são calculados sobre o lucro efetivamente obtido.

Vantagens:

  • Permite deduzir despesas operacionais reais;
  • Ideal para clínicas com margens de lucro menores.

O ponto de atenção aqui é que este é o regime mais complexo e exige controle detalhado de todas as movimentações financeiras.

Principais erros tributários cometidos por clínicas médicas

Mesmo com assessoria contábil, muitos erros se repetem na rotina das clínicas:

  • Escolha inadequada do regime tributário;
  • Falta de registro e controle de despesas dedutíveis;
  • Emissão incorreta ou ausência de notas fiscais;
  • Atraso no pagamento de tributos e obrigações acessórias;
  • Falta de integração entre sistema médico e contabilidade.

Esses erros, além de aumentarem a carga tributária, podem gerar multas e autuações fiscais. Por isso, um controle automatizado é essencial para manter a conformidade e evitar prejuízos.

Como a tecnologia simplifica a gestão tributária

Um sistema médico moderno vai além do agendamento de pacientes. Ele centraliza informações, gera relatórios financeiros automáticos e se integra à contabilidade, o que facilita o cálculo de impostos e o cumprimento das obrigações fiscais.

Com o Versatilis System, por exemplo, você pode:

  • Controlar o faturamento mensal com relatórios detalhados;
  • Gerenciar repasses médicos e despesas operacionais;
  • Organizar as informações necessárias para o contador;
  • Evitar divergências contábeis e garantir o envio correto dos dados ao contador.

Além disso, o sistema permite visualizar indicadores financeiros em tempo real, o que ajuda o gestor a tomar decisões mais estratégicas, como avaliar se o regime tributário atual continua sendo o mais vantajoso.

A importância do planejamento tributário para clínicas

Planejar a tributação é uma questão de sustentabilidade. Um planejamento tributário bem estruturado pode reduzir legalmente a carga fiscal, otimizar recursos e aumentar a lucratividade da clínica.

Esse processo envolve:

  • Simulações de enquadramento em diferentes regimes;
  • Projeções de faturamento e despesas;
  • Revisão de contratos e modelos de prestação de serviço;
  • Utilização estratégica de deduções e benefícios fiscais.

Assim, com o suporte da tecnologia, é possível ter dados confiáveis e atualizados para tomar decisões embasadas, algo essencial para a saúde financeira de qualquer clínica.

Conclusão: tecnologia e gestão fiscal caminhando juntas

A tributação de clínicas e consultórios é um tema complexo, mas pode ser simplificada com planejamento, controle e o uso da tecnologia certa

Ao adotar um sistema médico, você ganha tempo, evita erros e garante mais segurança em toda a gestão contábil e fiscal.

Com o Versatilis System, sua clínica passa a ter controle total sobre o faturamento, guias, relatórios e indicadores financeiros: tudo em um único ambiente, de forma simples e segura.

Por isso, se você quer entender como a tecnologia pode ajudar sua clínica a economizar e crescer com segurança fiscal, agende uma demonstração gratuita do Versatilis System e veja como simplificar sua gestão tributária na prática!

Richard Riviere

Especialista em Saúde Digital, CEO e Co-Fundador da Versatilis System, o sistema de gestão DEFINITIVO das clínicas do Brasil.

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